Izdavanje novih pasoša za građane Istočnoafrička zajednica je privremeno suspendovan kako bi se omogućilo da se nove najsavremenije karakteristike ugrade u sledeće izdanje. Trenutno, pasoši nisu mašinski čitljivi niti sadrže biometrijske podatke u umetnutim kompjuterskim čipovima, a kako bi bili šire prihvatljiviji, ovi novi dodaci prvo moraju biti razvrstani.
Pasoši su bili popularni u Ugandi i Keniji, gdje je putnicima trebalo samo jednom u šest mjeseci staviti pečat u pasoš ako prelaze državne granice u jednu od država članica EAC-a, ali su se pojavile i optužbe da su službenici za imigraciju na kopnenim granicama i aerodromima samo ignorirao ova pravila i ionako ih pečatirao kao nacionalne pasoše. Burundi i Ruanda, nakon što su se prošle godine pridružile EAC-u, još nisu implementirale izdavanje ovih putnih isprava.
EAC pasoši takođe nisu bili opšte prihvaćeni izvan regiona, pošto mnogi redovni putnici nose i nacionalne i EAC pasoše, situaciju koju je sekretarijat Istočnoafričke zajednice u Aruši takođe obećao da će rešiti na vreme za početak izdavanja pasoša EAC sledeće generacije . U međuvremenu, građani pet zemalja članica koristit će svoje nacionalne pasoše za putovanja širom regiona.